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作为研究员身份来到莫蒙特研究所的阿遥和阿晓，自然是跟着莫蒙特博士进行学习。
但是叶太郎只是为了获取莫蒙特研究所的训练师这个身份来到伽勒尔地区的，在和阿遥、阿晓一起生活了一周后，叶太郎就通过莫蒙特博士和罗伊先生的推荐，前往帕底亚地区的一所一级学校读书去了。
那是一所专门负责培育各类宝可梦职业的学校，叶太郎要在那里经历三年的短期学习，学习有关培育师的一切理论知识。
这让刚和朋友重归于好的阿遥有些不适应，但是他的不适应很快就被莫蒙特博士布置下来的一堆任务给取代。
莫蒙特研究所的成员一共是五名人类和三只宝可梦。
五名人类指莫蒙特博士和他的四名学生，其中一名是之前阿遥、阿晓见过的那名叫做竹野的学姐，她和他们一样来自别的地区；
另外一名则是来自帕底亚地区，一个叫做奈克的小麦色肤色的青年。
同时，奈克也是莫蒙特研究所内的二师兄。
还有一个大师姐叫做吉利，现在自己在宫门市内开设了一家小的研究所。
人类这边也就算了，真正让阿遥觉得炸裂的、则是研究所的那三只宝可梦成员……
也是加入研究所一周后、也就是叶太郎前往帕底亚地区学习后，阿遥、阿晓才知道，莫蒙特研究所建立在微寐森林内的原因，是因为在研究所的地下封印着另外一只传说中的宝可梦：无极汰那。
阿晓这种对于宝可梦本来就不太了解的，对于无极汰那并没有多的想法，只当做是和苍响、藏马然特同样的存在——毕竟无极汰那虽然说是被封印，但是除了被限制离开研究所地下那一大片区域外，没人想管他做什么。
阿遥则是在知道无极汰那的存在后直接麻了，一个小小的研究所里面，有苍响和藏马然特就算了、居然还有无极汰那……
他突然有点好奇，三木研究所的地下是不是也有关东地区的传说中的宝可梦了。
森博士：？
作为研究所内最小的两名成员，在阿遥阿晓来到研究所后，他们就直接承包了研究所内所有的杂务——除了做饭，因为这两个人做饭一个炸厨房一个容易吃死人，所以哪怕是最手残的莫蒙特博士，都不敢让兄弟两进厨房了。
阿晓则对着弟弟暗地对着自己比的v型手势有些无奈——为了不做饭，他和弟弟只能出此下策了。
在来到研究所半年后，莫蒙特博士在确认他们已经熟悉研究所内所有的事物后，开始教导二人如何选定适合自己的研究方向，在这个期间内，莫蒙特博士几乎带着他们天天泡在旷野地带内，研究所则被交给了临时被叫回去研究所的大师姐：吉利。
兄弟二人也是这个时候才知道，为什么莫蒙特博士当初会让罗伊去接他们——因为罗伊是他们大师姐的丈夫，也就是他们的大姐夫。
他们三个人在旷野地带内待了接近一年的时间，才分别确定下了兄弟二人的研究方向，罗伊也终于喜极而泣——因为他不被允许拥有进入微寐森林的资格，所以这半年来，他和吉利大师姐都是两地分居的状态。
大师姐对此表示：丢人！
只是定下了研究方向后的日子，并没有阿遥想的顺利。
阿遥的研究方向是有关宝可梦的进化，当初会选择这个方向，是因为阿遥在真的接触了宝可梦研究的内容才知道，这个职业并不是自己所想的那样，拥有无数的宝可梦知识就能胜任的，这个方向还是莫蒙特博士在了解了他的性格和兴趣方向后，帮他定下的。
他也在定下了研究方向后的半年发表出了第一篇论文，这也让对这个研究方向有些不确定的莫蒙特博士和他本人，都因此松了一口气。
阿晓的研究方向和他不一样，范围比较大，侧重点是宝可梦的形态不同，这之中包括了宝可梦的颜色不同、体型不同、不同地区导致的样子不同等等，只是阿晓这个研究方向和他不一样，是阿晓在了解了一年的宝可梦后，自己定下的。
并且阿晓的速度比阿遥要更快，在定下了研究方向的半年内，直接发表了三篇相关论文，最新的一篇论文甚至还引起了学术界的讨论，让阿晓以12岁的宝可梦研究员身份，小小的火了一把。
至少现在在不少宝可梦研究员眼里，莫蒙特研究所的朝田晓就是一个天才。
兄弟二人这样大的落差，也让阿遥多了很多的压力。
但是，阿遥显然并不是那种压力越大、动力越大的类型，在这种情况下，接连一年的时间内，阿遥都未能在自己的研究方向上取得新的进展。
反观阿晓那边，却接连发出了具有研究意义的论文。
但是阿遥的异常也很快被阿晓注意到了，为了顾及阿遥的情绪，阿晓也因此放慢了论文发表的速度，这让阿遥觉得更加难受了。
阿遥来到了这个世界13年，第一次、再次感觉到了前世那种说不出的憋屈感。
也让阿遥不由得有了一种委屈的情绪，如果当初他没有拉着阿晓跟他一起成为研究员的话，他的不足是不是不会被衬托的这样明显……
实际上阿遥也知道，不是他太弱、是阿晓真的就和那些外面的宝可梦研究员说的一样，天生就是吃这碗饭的，一般的研究员能够两三年有一个结果发表一篇拥有实质性效果的论文都很不容易了，阿遥这种定下研究方向后就能发表出一篇非水的论文，已经比很多宝可梦研究员要强了。
可是他的对比对象是阿晓的话，那就另当别论了。
阿遥的这种挫败和委屈，一直持续到了年底，见到了从帕底亚地区回来的叶太郎后，突然结束了。
因为叶太郎回到莫蒙特研究所第一件事情，就是邀请阿遥和他一起外出旅行。
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